文山壮族苗族自治州是中国滇黔桂古特有种子植物中心的重要组成部分，是中国和云南生物多样性的热点关键地区。近年来，文山州以就地保护为主、迁地保护为辅，突出极度濒危物种抢救性保护恢复，着力完善迁地保护体系，维护生物多样性和生态安全。

依托自然保护地开展就地保护。全面落实文山州建立以国家公园为主体的自然保护地体系实施方案，依托现有的自然保护地，通过区域划定、严格管理、监测调查等措施，保护和扩大珍稀濒危野生动植物物种及其栖息地、原生地，构筑以自然保护区为基础、其他保护地为补充的保护网络。

实行差异化近地保护。在自然保护区设置样地监测生境、加强巡护、严格种子采集，在集体林建立保护小区，对不同保护区域的植物原生地实行差异化近地保护。截至目前，已建立蒜头果种质资源保护、水松和喙核桃原生境保护、西畴青冈和德保苏铁人工扩繁及野外回归试验5个保护小区。

建设专类园开展迁地保护。在西畴县香坪山建设木兰科迁地保育园350亩，定植热带、亚热带木兰科及珍稀濒危树种30科147种，成为东南亚面积最大、种群数第二的珍稀濒危树木迁地保育种质基因库。同时，实施滇东南极小种群野生植物专类园项目并与树木园同步规划建设，项目规划总面积3412.2亩，全面开展极小种群野生植物回归和迁地保护。

目前，文山州已完成蒜头果、喙核桃、水松、西畴青冈、德保苏铁等12个急需保护物种保护项目建设，培育苗木6万余株，完成云南金花茶回归、迁地保护60株，分别完成蒜头果、水松、伯乐树、德保苏铁迁地保护3150株、30株、60株、15株，全州90%以上的濒危植物得到保护。